Direktorat Pengembangan Sumber Daya Manusia
merupakan bidang yang bertanggung jawab dalam menjaga internal ISMKMI, mengembangkan potensi, karakter, dan kapasitas SDM ISMKMI. Fungsi PSDM meliputi penjagaan dan pengawasan internal, penguatan ikatan kekeluargaan, peningkatan kapasitas diri, dan apresiasi SDM ISMKMI. PSDM juga dapat mengintervensi kebutuhan SDM pengurus nasional sesuai kondisi yang ada.

Direktorat Keilmuan dan Keprofesian
merupakan bidang yang bertanggung jawab pada berbagai kegiatan dalam rangka meningkatkan kualitas lulusan kesehatan masyarakat, pendidikan, kompetensi, kurikulum, dan profesi kesehatan masyarakat. Melalui upaya pencerdasan, penyebaran informasi dan edukasi terkait keilmuan kesehatan masyarakat, serta pembekalan dan kesiapan dunia pasca kampus.

Direktorat Advokasi
merupakan bidang yang bertanggung jawab melakukan segala bentuk advokasi terhadap kebijakan kesehatan kepada pembuat dan pengambil kebijakan, baik itu advokasi yang sifatnya vertikal maupun horizontal. Keterlibataan advokasi dapat menyentuh pihak pemerintah dan swasta serta mengkaji berbagai isu kesehatan yang relevan yang selanjutnya dapat dikolaborasikan dengan bidang lain.

Direktorat Pengabdian Masyarakat
merupakan bidang yang bertanggung jawab dalam memfasilitasi gerakan masyarakat sehat yang sinergis dalam rangka peningkatan derajat kesehatan masyarakat melalui aksi nyata untuk menanggapi dan menjawab berbagai kesehatan di masyarakat yang relevan dengan mengoptimalkan keterlibatan seluruh anggota ISMKMI. Pengabdian ini sebagai bentuk respon dan peran aktif mahasiwaa kesmas se-Indonesia dalam mewujudkan indonesia sehat.